blosumG_20-20_55

#  Rectangular BLOSUM Scoring Matrix 20x20 in 1/3 Bit Units
#  Blocks Database = blocks.dat
#  Cluster Percentage: >= 55
#  Entropy =   0.5637, Expected =  -0.4179

     C   F   Y   W   M   L   I   V   G   P   A   T   S   N   H   Q   E   D   R   K
C   13  -3  -3  -4  -2  -2  -2  -1  -3  -3   0  -1  -1  -3  -4  -4  -4  -4  -4  -4 
F   -3   9   4   2   0   1   0  -1  -4  -5  -3  -3  -3  -4  -1  -4  -4  -5  -3  -4 
Y   -3   4   9   3  -1  -1  -1  -2  -4  -4  -2  -2  -2  -2   2  -1  -2  -3  -2  -2 
W   -4   2   3  15  -2  -3  -3  -4  -3  -5  -4  -3  -4  -5  -3  -2  -3  -5  -3  -4 
M   -2   0  -1  -2   8   3   2   1  -3  -3  -1  -1  -2  -3  -2   0  -3  -4  -2  -2 
L   -2   1  -1  -3   3   6   2   1  -5  -4  -2  -2  -3  -4  -3  -3  -4  -5  -3  -3 
I   -2   0  -1  -3   2   2   6   4  -5  -3  -2  -1  -3  -4  -4  -4  -4  -4  -4  -4 
V   -1  -1  -2  -4   1   1   4   5  -4  -3   0   0  -2  -4  -4  -3  -3  -4  -3  -3 
G   -3  -4  -4  -3  -3  -5  -5  -4   8  -3   0  -2   0   0  -2  -2  -3  -2  -3  -2 
P   -3  -5  -4  -5  -3  -4  -3  -3  -3  10  -1  -1  -1  -2  -3  -1  -1  -2  -3  -1 
A    0  -3  -2  -4  -1  -2  -2   0   0  -1   5   0   2  -2  -2  -1  -1  -2  -2  -1 
T   -1  -3  -2  -3  -1  -2  -1   0  -2  -1   0   6   2   0  -2  -1  -1  -1  -1  -1 
S   -1  -3  -2  -4  -2  -3  -3  -2   0  -1   2   2   5   1  -1   0   0   0  -1   0 
N   -3  -4  -2  -5  -3  -4  -4  -4   0  -2  -2   0   1   8   1   0   0   2  -1   0 
H   -4  -1   2  -3  -2  -3  -4  -4  -2  -3  -2  -2  -1   1  11   1  -1  -1   0   0 
Q   -4  -4  -1  -2   0  -3  -4  -3  -2  -1  -1  -1   0   0   1   7   2   0   1   2 
E   -4  -4  -2  -3  -3  -4  -4  -3  -3  -1  -1  -1   0   0  -1   2   7   2   0   1 
D   -4  -5  -3  -5  -4  -5  -4  -4  -2  -2  -2  -1   0   2  -1   0   2   8  -2  -1 
R   -4  -3  -2  -3  -2  -3  -4  -3  -3  -3  -2  -1  -1  -1   0   1   0  -2   8   3 
K   -4  -4  -2  -4  -2  -3  -4  -3  -2  -1  -1  -1   0   0   0   2   1  -1   3   6 

Lambda = 0.226432, K+ = 0.122685, (K- = 0.097826, C = 0.109787, delta = 1)

Gumbel parameters

Lambda: 0.226432     K: 0.122685     Query size :     Bank size :    
e-value 0.0001 0.001 0.01 0.1 1.0 10.0
score threshold 122 112 102 92 82 72

Complementary files